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    浙江大學基因組科學(第57期)研習班通知

    發布時間:2019-03-04 10:20:19

    總 期 數:57期   
    開 班 時 間:2019年04月19日-26日(19日全天報到,20日起授課)  
    上 課 地 點:浙江杭州·浙江大學華家池校區  
     
    隨著眾多生物基因組測序項目的完成,生物學數據正在加速度增長。如何科學地分析和注釋這些高通量數據,已成為生物學工作者急需學習和解決的問題。  
     
    浙江大學“基因組科學研習班”項目創始于2003年10月,由DNA雙螺旋結構的發現者詹姆斯•杜威•沃森教授與浙江大學沃森研究院首任院長楊煥明教授共同創辦,本期研習班邀請北京基因組所于軍教授、胡松年教授為您講授基因組學基礎知識和前沿進展、二代測序等實驗技術的關鍵事項;浙江大學楊軍教授、陳銘教授、鐘伯雄教授、徐建紅教授等多位基因組領域大咖專家為你在高通量分析研究方法和思路方面答疑解惑。 
     
    本研習班四次榮獲“浙江大學優秀項目創新獎”,一次入選“浙江大學國家級專業技術人員繼續教育基地重點扶持項目”,已累計舉辦56期,學員遍布全國,累計培訓學員5800余名。每期均不乏教授、博導參加培訓,更受到博士后、碩博生等年輕學者的青睞。他們中有一些帶著課題或技術問題前來交流和聯系,不少學員通過本研習班建立了長期協作關系,共同申請國家重大研究計劃項目、國家自然科學基金等,共同發表論文,其中不少優秀的研究成果,已在SCI期刊上發表。 
     
    一、培訓班上課內容 
    上課內容涵蓋“基因組學—蛋白質組學—系統生物學”的研究方法、技術思路、前沿進展及其在各生物學科中的應用。  
    核心課程包括:  
    1. 基因組的比較研究、DNA測序技術原理與進展(于軍 教授)  
    2. 轉錄組的測定與分析、大規模測序方法及應用、微生物基因組學、基因組學與精準醫學(胡松年教授)  
    3. 系統生物學導論及高通量分析技術應用(楊軍 教授)  
    4. 系統生物學建模分析(陳銘 教授)  
    5. 蛋白質組學概論及應用 (鐘伯雄 教授)  
    6. 基因組學在醫學中的應用(祁鳴 教授)  
    二、培訓班上機內容   
    本研習班上機實習課采用 “跟我學”方式,學習實踐各類基礎生物信息學軟件,每人一臺PC機跟著大屏幕一步步學會基因組、蛋白質組學數據分析的基本方法。  
    主要內容如下:   
    實習一: 基因組數據注釋和功能分析  
    通過序列比對工具BLAST的學習,了解基因功能注釋的原理;介紹多序列聯配工具ClustalX及分子進化分析軟件MEGA4,掌握系統發生樹繪制的基本方法,認識基因復制在進化上的功能;學習基因序列分析常用的數據庫和軟件。  
    實習二: 轉錄組數據分析  
    介紹轉錄組數據分析的基本流程及其原理;通過對tophat、cufflinks、R等轉錄組數據分析工具的介紹及演示,了解基于二代測序數據的轉錄組分析流程及常用分析方法; 利用kegg、GOstat、DAVID等在線工具挖掘轉錄組數據的生物學意義。  
    實習三:蛋白質結構與功能分析  
    從數據庫搜索感興趣的蛋白質氨基酸序列開始,接著對蛋白質基本理化性質、二級結構、和三維空間結構和序列模體進行分析,預測目標蛋白的生物功能。  
    實習四:蛋白質組學數據分析  
    使用X!Tandem、Mascot、Sequest等軟件鑒定蛋白質質譜數據,將質譜結果匹配到蛋白質組數據庫鑒定蛋白;使用TPP軟件包進行統計學分析和優化檢索結果練習。   
    實習五:系統生物學軟件實習-----網絡結構顯示與分析  
    利用Cytoscape系統生物學分析軟件,分析蛋白-蛋白相互作用,展示分子網絡系統,并與基因表達等數據整合。  
    三、培訓對象   
    1.無生物信息學背景,希望了解生物信息學的學員;   
    2.計劃開展各類組學研究的科研人員;   
    3.已有組學數據需了解分析方法的研究人員;   
    4.有志從事生物信息學相關工作的學生或者技術人員。  
    四、報名方法 
    若有參加意向,請直接將回執發至genetrain@zju.edu.cn,我們會回函并在浙江大學繼續教育系統錄入,待排定課表后發給您詳細課程表。待您再次確認后,發給您報到通知并排定上機號。培訓結束,發放浙江大學繼續教育證書。 
    五、教材(會務組提供)
     《DNA和蛋白質序列數據分析工具》(第三版),薛慶中等編著,科學出版社。

    六、其他事項  
    收費標準:注冊費為¥3800/人(可轉賬、現金、刷卡【含公務卡】)。  
    食宿可統一安排,費用自理。  
    聯 系 人:代成林 18757558672   咨詢電話:0571-88206579  
    電子郵件地址:genetrain@zju.edu.cn; daichenglin@zju.edu.cn。  
    因本課程天數較多,報名學員因故缺席部分課程,可聯系會務組在后續培訓班中免費旁聽。  
     

    會議時間2019-04-19至2019-04-26
    會議地點杭州

    聲明:

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