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    浙江大學基因組科學(第33期/總53期)研習班通知

    發布時間:2017-09-12 10:58:41

     

    總 期 數:53期

    辦 學 歷 史:16年(2002年-2017年)

    開 班 時 間:2017年11月17日-24日(17日為全天報到日,18日開始上課)

    上 課 地 點:杭州 浙江大學華家池校區

      

    隨著眾多生物基因組測序項目的完成,生物學數據正在加速度增長。如何科學地分析和注釋這些高通量數據,已成為生物學工作者急需學習和解決的問題。

    浙江大學基因組科學研習班邀請北京基因組所于軍教授、胡松年教授為您講授基因組學基礎知識和前沿進展、基因轉錄組的測定及分析、二代測序等實驗技術的關鍵事項;浙江大學楊軍教授、陳銘教授等講解系統生物學及高通量分析研究方法和思路。

    研習班多次獲得浙江大學優秀項目創新獎,目前已舉辦52期,學員來自全國30余個省市,累計培訓學員5200余名。每次研習班不乏教授、博導參加,更受到博士后、碩博生等年輕學者的青睞。他們中有一些帶著課題或問題前來交流和聯系,不少學員通過研習班建立了長期協作關系,共同申請國家973863課題,共同發表論文,其中不少優秀的研究成果,已在SCI期刊上發表。

    一、培訓班上課內容
          上課內容涵蓋基因組學蛋白質組學系統生物學的研究方法、技術思路、前沿進展及其在各生物學科中的應用。

    核心課程包括

    1. 基因組的比較研究、DNA測序技術原理與進展(講課人:于 軍 教授)

    2. 轉錄組的測定分析、大規模測序方法及應用、微生物基因組學基因組學與精準醫學(講課人:胡松年教授)

    3. 系統生物學建模分析及高通量分析技術應用(講課人:楊軍、陳銘教授等)

    4. 蛋白質組學概論及應用 (講課人:鐘伯雄教授)

    二、培訓班上機內容
          上機實習課采用 跟我學方式,學習實踐各類基礎生物信息學軟件,每人一臺PC機跟著大屏幕一步步學會基因組、蛋白質組學數據分析的基本方法。

    主要內容如下:

    實習一: 基因組數據注釋和功能分析
          通過序列比對工具BLAST的學習,了解基因功能注釋的原理;介紹多序列聯配工具ClustalX及分子進化分析軟件MEGA4,掌握系統發生樹繪制的基本方

    法,認識基因復制在進化上的功能;學習基因序列分析常用的數據庫和軟件。

    實習二: 轉錄組數據分析
          介紹轉錄組數據分析的基本流程及其原理;通過對tophatcufflinksR等轉錄組數據分析工具的介紹及演示,了解基于二代測序數據的轉錄組分析流程及

    常用分析方法; 利用keggGOstatDAVID等在線工具挖掘轉錄組數據的生物學意義。

    實習:系統生物學軟件實習-----網絡結構顯示與分析
          利用Cytoscape系統生物學分析軟件,分析蛋白-蛋白相互作用,展示分子網絡系統,并與基因表達等數據整合。  

    實習四:蛋白質結構與功能分析
          從數據庫搜索感興趣的蛋白質氨基酸序列開始,接著對蛋白質基本理化性質、二級結構、和三維空間結構和序列模體進行分析,預測目標蛋白的生物功

    能。

    實習五: 蛋白質組質譜分析
          使用XTandemMascotSequest等軟件鑒定蛋白質質譜數據,將質譜結果匹配到蛋白質組數據庫鑒定蛋白;使用TPP軟件包進行統計學分析和優化

    檢索結果練習。

    三、培訓對象

    1. 無生物信息學背景,希望了解生物信息學的學員;

    2. 計劃開展各類組學研究的科研人員;

    3. 已有組學數據需了解分析方法的研究人員;

    4. 有志從事生物信息學相關工作的學生或者技術人員。

    四、報名方法
          有參加意向,直接將回執發至genetrain@zju.edu.cn,我們會即刻回函并在浙江大學繼續教育系統錄入,待排定課表后發給您詳細程表。待您再次

    確認后,發給您報到通知并排定上機號培訓結束,發放浙江大學繼續教育證書。(尚有少量名額,請盡快報名)

    點擊下載: 浙江大學基因組學研習班報名表.xlsx

    五、教材(會務組提供

    "DNA和蛋白質序列數據分析工具(第三版), 薛慶中等編著,

    科學出版社出版 20126月發行。

     

     

     

     

     

    "基因組學概論”(第二版),薛慶中等編著,科學 出版社

    出版 2016年1月發行。

     

     

    六、其他事項

    收費標準:注冊費為¥3800/人(可轉賬、現金、刷卡【含公務卡】)。

    食宿可統一安排,費用自理。

    人:代成林 18757558672      咨詢電話:0571-88206579

    電子郵件地址:genetrain@zju.edu.cn;daichenglin@zju.edu.cn

     

     

    會議時間2017-11-17至2017-11-24
    會議地點杭州

    聲明:

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